Leena Salmela

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Coautores

Jorma TarhioProfessor Emeritus, Aalto UniversityDirección de correo verificada de aalto.fi
Veli MäkinenProfessor of Computer Science, University of HelsinkiDirección de correo verificada de helsinki.fi
Eric RivalsLIRMM, Centre National Recherche Scientifique (CNRS) & Univ. Montpellier, FranceDirección de correo verificada de lirmm.fr
Riku WalveUniversity of HelsinkiDirección de correo verificada de cs.helsinki.fi
Christina BoucherUniversity of FloridaDirección de correo verificada de ufl.edu
Simon J. PuglisiProfessor, Department of Computer Science, University of HelsinkiDirección de correo verificada de cs.helsinki.fi
Alexandru I. TomescuDepartment of Computer Science, University of HelsinkiDirección de correo verificada de helsinki.fi
Niko VälimäkiPostdoctoral researcher, University of HelsinkiDirección de correo verificada de cs.helsinki.fi
Travis GagieAssociate Professor at Dalhousie UniversityDirección de correo verificada de dal.ca
Jan SchröderPostdoc researcher, Monash UniversityDirección de correo verificada de monash.edu
Gonzalo NavarroUniversity of ChileDirección de correo verificada de dcc.uchile.cl
Pasi RastasResearch Associate, University of Helsinki, Institute of BiotechnologyDirección de correo verificada de helsinki.fi
Martin D MuggliAlumniDirección de correo verificada de alumni.colostate.edu
Bahar AlipanahiDelfi DiagnosticsDirección de correo verificada de delfidiagnostics.com
Francisco ClaudeLinkedInDirección de correo verificada de recoded.cl
Kristoffer SahlinAssistant Professor at Department of Mathematics, Stockholm UniversityDirección de correo verificada de math.su.se
Petri AuvinenInstitute of Biotechnology, University of HelsinkiDirección de correo verificada de helsinki.fi
Mikko FrilanderGroup leader/Research Director, Institute of Biotechnology, University of HelsinkiDirección de correo verificada de helsinki.fi
Patrik KoskinenLAB - University of Applied SciencesDirección de correo verificada de lab.fi
Hanski IProfessor of Ecology, University of HelsinkiDirección de correo verificada de helsinki.fi

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Leena Salmela

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Bioinformatics String algorithms


Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
LoRDEC: accurate and efficient long read error correction L Salmela, E Rivals Bioinformatics 30 (24), 3506-3514, 2014	614	2014
The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera V Ahola, R Lehtonen, P Somervuo, L Salmela, P Koskinen, P Rastas, ... Nature communications 5 (1), 4737, 2014	213	2014
Correcting errors in short reads by multiple alignments L Salmela, J Schröder Bioinformatics 27 (11), 1455-1461, 2011	205	2011
Correction of sequencing errors in a mixed set of reads L Salmela Bioinformatics 26 (10), 1284-1290, 2010	149	2010
Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs L Salmela, R Walve, E Rivals, E Ukkonen Bioinformatics 33 (6), 799-806, 2017	134	2017
Multipattern string matching with q-grams L Salmela, J Tarhio, J Kytöjoki Journal of Experimental Algorithmics (JEA) 11, 1.1-es, 2007	117	2007
Fast scaffolding with small independent mixed integer programs L Salmela, V Mäkinen, N Välimäki, J Ylinen, E Ukkonen Bioinformatics 27 (23), 3259-3265, 2011	95	2011
Normalized N50 assembly metric using gap-restricted co-linear chaining V Mäkinen, L Salmela, J Ylinen BMC bioinformatics 13, 1-5, 2012	43	2012
Flight‐induced changes in gene expression in the Glanville fritillary butterfly J Kvist, ALK Mattila, P Somervuo, V Ahola, P Koskinen, L Paulin, ... Molecular Ecology 24 (19), 4886-4900, 2015	39	2015
Bit-parallel search algorithms for long patterns B Ďurian, H Peltola, L Salmela, J Tarhio Experimental Algorithms: 9th International Symposium, SEA 2010, Ischia …, 2010	38	2010
mpscan: Fast Localisation of Multiple Reads in Genomes E Rivals, L Salmela, P Kiiskinen, P Kalsi, J Tarhio Algorithms in Bioinformatics: 9th International Workshop, WABI 2009 …, 2009	33	2009
Tuning string matching for huge pattern sets J Kytöjoki, L Salmela, J Tarhio Combinatorial Pattern Matching: 14th Annual Symposium, CPM 2003 Morelia …, 2003	31	2003
Gap filling as exact path length problem L Salmela, K Sahlin, V Mäkinen, AI Tomescu Journal of Computational Biology 23 (5), 347-361, 2016	28	2016
Forbidden patterns J Fischer, T Gagie, T Kopelowitz, M Lewenstein, V Mäkinen, L Salmela, ... LATIN 2012: Theoretical Informatics: 10th Latin American Symposium, Arequipa …, 2012	27	2012
String matching with alphabet sampling F Claude, G Navarro, H Peltola, L Salmela, J Tarhio Journal of Discrete Algorithms 11, 37-50, 2012	26	2012
Fast parameterized matching with q-grams L Salmela, J Tarhio Journal of Discrete Algorithms 6 (3), 408-419, 2008	22	2008
Approximate Boyer-Moore string matching for small alphabets L Salmela, J Tarhio, P Kalsi Algorithmica 58, 591-609, 2010	21	2010
Indexing variable length substrings for exact and approximate matching G Navarro, L Salmela String Processing and Information Retrieval: 16th International Symposium …, 2009	19	2009
Error correcting optical mapping data K Mukherjee, D Washimkar, MD Muggli, L Salmela, C Boucher GigaScience 7 (6), giy061, 2018	16	2018
Algorithms for weighted matching L Salmela, J Tarhio String Processing and Information Retrieval: 14th International Symposium …, 2007	12	2007

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