Alexander R Pico

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Coautores

Chris EveloHead Department of Bioinformatics - BiGCaT, Maastricht University ORCID:0000-0002-5301-3142Dirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
Bruce ConklinInvestigator Gladstone and Professor at UCSFDirección de correo verificada de gladstone.ucsf.edu
Martina KutmonAssistant professor, Maastricht University, The NetherlandsDirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
Thomas KelderCTO, EdgeLeap, The NetherlandsDirección de correo verificada de edgeleap.com
John H MorrisUCSFDirección de correo verificada de cgl.ucsf.edu
Anders RiuttaInstitute for Data Science and Biotechnology, Gladstone InstitutesDirección de correo verificada de andersriutta.com
Egon WillighagenTGX, NUTRIM, Maastricht University/NL, ORCID:0000-0001-7542-0286, https://social.edu.nl/@egonwDirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
Gary BaderProfessor of Molecular Genetics and Computer Science, The Donnelly Centre, University of TorontoDirección de correo verificada de utoronto.ca
Andra WaagmeesterMicelio bvbaDirección de correo verificada de micelio.be
Trey IdekerUniversity of California San DiegoDirección de correo verificada de ucsd.edu
Keiichiro OnoUniversity of California, San DiegoDirección de correo verificada de ucsd.edu
Ryan A. MillerMaastricht UniversityDirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
Nathan SalomonisAssociate Professor Cincinnati Children's Hospital Medical CenterDirección de correo verificada de cchmc.org
Dr. Susan Steinbusch-CoortAssociate Professor, dept of Bionformatics-BiGCaT, NUTRIM, Maastricht University, NLDirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
Marvin MartensPostDoctoral Researcher, Maastricht UniversityDirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
Venkatesh L. Murthy, MD, PhDAssociate Chief of Cardiology for Translational Research & Innovation, University of MichiganDirección de correo verificada de umich.edu
Anwesha Bohler (née Dutta)Program Manager, AmazonDirección de correo verificada de amazon.com
Alexander C ZambonDepartment of Pharmaceutical Sciences Keck Graduate InstituteDirección de correo verificada de kgi.edu
Elisa CirilloDirección de correo verificada de maastrichtuniversity.nl
John K. WienckeUniversity of California San FranciscoDirección de correo verificada de ucsf.edu

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Integration of biological networks and gene expression data using Cytoscape MS Cline, M Smoot, E Cerami, A Kuchinsky, N Landys, C Workman, ... Nature protocols 2 (10), 2366-2382, 2007	2772	2007
Glioma Groups Based on 1p/19q, IDH, and TERT Promoter Mutations in Tumors JE Eckel-Passow, DH Lachance, AM Molinaro, KM Walsh, PA Decker, ... New England Journal of Medicine 372 (26), 2499-2508, 2015	2083	2015
A travel guide to Cytoscape plugins R Saito, ME Smoot, K Ono, J Ruscheinski, PL Wang, S Lotia, AR Pico, ... Nature methods 9 (11), 1069-1076, 2012	1523	2012
Cytoscape automation: empowering workflow-based network analysis D Otasek, JH Morris, J Bouças, AR Pico, B Demchak Genome biology 20, 1-15, 2019	1167	2019
WikiPathways: a multifaceted pathway database bridging metabolomics to other omics research DN Slenter, M Kutmon, K Hanspers, A Riutta, J Windsor, N Nunes, ... Nucleic acids research 46 (D1), D661-D667, 2018	932	2018
WikiPathways: pathway editing for the people AR Pico, T Kelder, MP Van Iersel, K Hanspers, BR Conklin, C Evelo PLoS biology 6 (7), e184, 2008	789	2008
Dynamic and coordinated epigenetic regulation of developmental transitions in the cardiac lineage JA Wamstad, JM Alexander, RM Truty, A Shrikumar, F Li, KE Eilertson, ... Cell 151 (1), 206-220, 2012	667	2012
WikiPathways: connecting communities M Martens, A Ammar, A Riutta, A Waagmeester, DN Slenter, K Hanspers, ... Nucleic acids research 49 (D1), D613-D621, 2021	664	2021
WikiPathways: building research communities on biological pathways T Kelder, MP Van Iersel, K Hanspers, M Kutmon, BR Conklin, CT Evelo, ... Nucleic acids research 40 (D1), D1301-D1307, 2012	641	2012
Variants in the CDKN2B and RTEL1 regions are associated with high-grade glioma susceptibility M Wrensch, RB Jenkins, JS Chang, RF Yeh, Y Xiao, PA Decker, ... Nature genetics 41 (8), 905-908, 2009	578	2009
Crystal structure of Hck in complex with a Src family–selective tyrosine kinase inhibitor T Schindler, F Sicheri, A Pico, A Gazit, A Levitzki, J Kuriyan Molecular cell 3 (5), 639-648, 1999	555	1999
WikiPathways: capturing the full diversity of pathway knowledge M Kutmon, A Riutta, N Nunes, K Hanspers, EL Willighagen, A Bohler, ... Nucleic acids research 44 (D1), D488-D494, 2016	499	2016
Integrated proteogenomic characterization of clear cell renal cell carcinoma DJ Clark, SM Dhanasekaran, F Petralia, J Pan, X Song, Y Hu, ... Cell 179 (4), 964-983. e31, 2019	495	2019
PathVisio 3: an extendable pathway analysis toolbox M Kutmon, MP van Iersel, A Bohler, T Kelder, N Nunes, AR Pico, CT Evelo PLoS computational biology 11 (2), e1004085, 2015	484	2015
Proteogenomic and metabolomic characterization of human glioblastoma LB Wang, A Karpova, MA Gritsenko, JE Kyle, S Cao, Y Li, D Rykunov, ... Cancer cell 39 (4), 509-528. e20, 2021	445	2021
Presenting and exploring biological pathways with PathVisio MP van Iersel, T Kelder, AR Pico, K Hanspers, S Coort, BR Conklin, ... BMC bioinformatics 9, 1-9, 2008	436	2008
Structure of the RCK domain from the E. coli K+ channel and demonstration of its presence in the human BK channel Y Jiang, A Pico, M Cadene, BT Chait, R MacKinnon Neuron 29 (3), 593-601, 2001	399	2001
Proteogenomic characterization of endometrial carcinoma Y Dou, EA Kawaler, DC Zhou, MA Gritsenko, C Huang, L Blumenberg, ... Cell 180 (4), 729-748. e26, 2020	359	2020
Structure of the human BK channel Ca2+-activation apparatus at 3.0 Å resolution P Yuan, MD Leonetti, AR Pico, Y Hsiung, R MacKinnon Science 329 (5988), 182-186, 2010	357	2010
GenMAPP 2: new features and resources for pathway analysis N Salomonis, K Hanspers, AC Zambon, K Vranizan, SC Lawlor, ... BMC bioinformatics 8, 1-12, 2007	330	2007

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